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大戸 陽平 / Yohei Ohto
Ph.D Student — Bioinformatics & Drug Discovery
Posts
publications
Exploring Multi-Objective Trade-offs in Reference Compound Selection for Validation Studies of Toxicity Assays
Published in arXiv, 2025
毒性評価の検証に用いる対照化合物の選定を、化学構造・物性・毒性の多様性を考慮する多目的設計問題として検討しました。
Recommended citation: Yohei Ohto, Tadahaya Mizuno, Yasuhiro Yoshikai, Hiromi Fujimoto, Hiroyuki Kusuhara. (2025). Exploring Multi-Objective Trade-offs in Reference Compound Selection for Validation Studies of Toxicity Assays. arXiv preprint arXiv:2505.07140.
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Defining and Evaluating Cell–Cell Relation Extraction from Biomedical Literature under Realistic Annotation Constraints
Published in bioRxiv, 2025
生物医学文献から細胞間の関係を抽出する課題を定義し、注釈付きデータを構築して複数のモデルを評価しました。
Recommended citation: Mei Yoshikawa, Tadahaya Mizuno, Yohei Ohto, Hiromi Fujimoto, Hiroyuki Kusuhara. (2025). Defining and Evaluating Cell–Cell Relation Extraction from Biomedical Literature under Realistic Annotation Constraints. bioRxiv preprint doi:10.1101/2025.12.01.691726.
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talks
Selection of reference compound list with machine learning toward validation of safety assessment methods Permalink
Published:
発表概要（日本語）:
安全性評価手法の性能評価に向けた機械学習による対照化合物選定の検討 / Selection of reference compound list with machine learning toward validation of safety assessment methods
Published:
発表概要（日本語）:
特許情報に基づく時間軸を考慮した毒性予測の検討 / Consideration of toxicity prediction incorporating temporal information from patent data Permalink
Published:
発表概要（日本語）:
特許時系列情報の医薬品への適用の妥当性とその in silico 毒性予測への応用 / Validity and application of temporal information extracted from patent information
Published:
発表概要（日本語）:
Validity and application of temporal information extracted from patent information Permalink
Published:
発表概要（日本語）:
Systematic Evaluation of Vocabulary Size in ModernBERT Models for the Pharmaceutical Domain Permalink
Published:
医薬分野を対象としたModernBERTモデルの語彙サイズについて、体系的に評価した研究をポスター発表しました。
teaching
東京大学薬学部 学生実習(分子薬物動態学教室)
学部学生実習, 東京大学薬学部, 2023年度
分子薬物動態学教室が担当する薬学部学生実習において、TA(指導補助)として参加しました。
東京大学薬学部 学生実習(分子薬物動態学教室)
学部学生実習, 東京大学薬学部, 2024年度
分子薬物動態学教室が担当する薬学部学生実習において、TA(指導補助)として参加しました。
東京大学薬学部 学生実習(分子薬物動態学教室)
学部学生実習, 東京大学薬学部, 2025年度
分子薬物動態学教室が担当する薬学部学生実習において、TA(指導補助)として参加しました。